چاپ کردن
شناسایی جمعیتهای میکروبی موجود در محل فرسودگیهای زیستی نسخ خطی با رویکرد میکروسکوپی، مولکولی و وابسته به کشت / نگار رئیس نیا - science- دانشکدگان علوم
|
چکیده:
منابع کتابخانهای از جمله نسخ خطی و نادر با توجه به ارزش معنوی و تاریخی، مستلزم حفاظت بهینه و شناسایی و کنترل عوامل آسیبرسان میباشند. در این مطالعه پس از غربالگری و ارزیابی وابسته به کشت نسخ خطی کتابخانه ملی ایران، جوامع میکروبی (باکتریها، قارچها، آرکیها) کلونیزه شونده در یک نسخه خطی ( قرن پنجم ه.ق، 11 میلادی) با رویکردهای مشاهده میکروسکوپی، وابسته به کشت و توالییابی Illumina MiSeq مورد ارزیابی قرار گرفت. همچنین، برای ارزیابی مخاطرات بالقوه ناشی از میکروارگانیسمهای کلونیزه شونده، قابلیت تولید آنزیمهای هیدرولیتیک ترکیبات آلی، توسط جدایههای میکروبی، بررسی گردید. مشاهده میکروسکوپی نمونههای کاغذی با FESEM، حضور سلولهای باکتری، کونیدیها و میسلیوم قارچی را در میان الیاف سلولز نشان داد. 11 سویه باکتری شامل گونههایی از جنسهای Bacillus، Streptomyces و Corynebacterium و 4 سویه قارچ، مشتمل بر گونههایی از جنسهای Aspergillus و Alternaria جدا گردید که با توالییابی ژن 16S rRNA و قطعه ITS، با مقایسه در پایگاههای داده EzBioCloud و MycoBank شناسایی شدند. آنالیز نتایج توالییابی Illumina بیانگر حضور 20 جنس باکتریایی از قبیل: Pseudomonas ،Bacillus،Citrococcus، Promicromonospora، Carnobacterium، Arthrobacter، Salinibacterium، Streptomyces ، Paracoccus بود. Pseudomonas فراوانترین جنس باکتریایی (58 %) و Pseudomonas stutzeri (55.19) فراوانترین گونه، بر اساس میزان خوانشها بودند. نتایج توالییابی آمپلیکونهای قارچی، مبین حضور 62 جنس از قبیل: Penicillium، Aspergillus، Alternaria، Mucor، Chaetomium بود. در سطح جنس، Penicillium ( 58.89%) و Aspergillus (33.02%) و در سطح گونه Penicillium polonicum (55.45%) و Aspergillus ruber (22.55%) فراوانترین تاکسونهای جمعیت قارچی را تشکیل دادهاند. نتایج جستجوی آرکیها در جمعیت میکروبی نسخه خطی توسط روش وابسته به کشت و توالی یابی آمپلیکونی High-throghtput منفی بود. بر اساس مطالعه حاضر SEM ابزار مناسبی برای غربالگری اولیه کلونیزاسیون میکروارگانیسمهای آسیب رسان به منابع کاغذی میباشد. برای شناسایی بهینه ترکیب و تنوع در جوامع میکروبی، رویکرد ترکیبی وابسته به کشت و توالییابی High-throghtput از مزیت قابل توجهی نسبت به استفاده انفرادی از این روشها، برخوردار است. فعالیت آنزیمهای هیدولیتیک ترکیبات آلی در جدایههای میکروبی خطر بالقوه آسیبهای زیستی را نشان داد.