Sayed Amir Marashi

Associate Professor

Update: 2024-11-15

Sayed Amir Marashi

College of Science / BIOTECHNOLOGY

P.H.D dissertations

  1. بررسی پاسخ برنج (Oryza sativa) به تنش سرما ازطریق اختصاصی کردن مدل متابولیکی ژنوم مقیاس
    فاطمه سلطانی 2024
  2. شناسایی برهمکنش های کشنده توامان در سرطان با استفاده از شبکه های متابولیکی
    احسان زنگنه 2024
  3. رتبه بندی خصیصه ها در آنالیز های متاژنومی مربوط به میکروبیوم سرطان
    زهرا توکل همدانی 2023
  4. چارچوبی محاسباتی برای شناسایی استراتژی‌های حذف ژن برای بهینه‌سازی تولید متابولیت در کنسرسیوم‌های میکروبی دو سویه‌ای
    سورن سلاجقه 2023
  5. بهینه سازی تولید یک پادتن تک دودمانی در سلولهای CHO به کمک روشهای زیست شناسی سامانه ها
    حمیده فولادیها 2022
  6. فارماکولوژی سامانه ای ساختاری چارچوبی برای ادغام شبکه متابولیک و غربالگری مجازی مبتنی بر ساختار برای کشف دارو علیه پاتوژن ها
    المیرا نظر شده 2022
  7. به دست آوردن تابع هدف شبکه متابولیک با استفاده از داده های transcriptome
    فاطمه حیدری 2022
  8. بازسازی شبکه متابولیک باکتری متعلق به جنس مایکروباکتریوم به عنوان یک سویه بالقوه مفید در تولید هیدروژن توسط ریزجلبک
    حمیدرضا علی مردان 2021
  9. ساخت و تعیین خصوصیات گیرنده Synotch برعلیه آنتی ژن CD19
    یاسمن اسعدی 2021
  10. تشخیص نمونه های مربوط به افراد سالم از نمونه های بیماران مبتلا به سرطان روده با استفاده از آنالیز توالی های متاژنوم حاصل از مدفوع توسط روش های یادگیری ماشین
    آرمین سلیمانی نیا 2021
  11. مهندسی متابولیک مسیر تولید اتانول به کمک مدل شبکه متابولیک Zymomonas mobilis و ارزیابی اثر آن بر میزان تولید محصول
    هدی نوری 2021
  12. بازسازی شبکه متالولیک اسپرم انسان : کنکاشی پیرامون مکانیسم نازایی مردان به منظور درک آن
    آروند اصغری خنکداری 2021
  13. ارائه یک روش محاسباتی مبتنی بر سیستم های توصیه گر برای پیش بینی عوارض جانبی داروها
    سهیلا شعبانی مشکول 2020
  14. شناسایی امضاهای مولکولی اختصاصی زیرگونه های مختلف بیماری آلزایمر
    آناهیتا نظری یایچی 2020
  15. ارائه رویکردی برای بررسی تغییرات عملکردی و تاکسونومیکی میکروبیوم پروکاریوتی روده انسان
    محمدحسین نوروزی بیرامی 2020
  16. مطالعه تجربي و مدل سازي متابوليسم توليد هيدروژن در كنسرسيوم جلبك- باكتري
    ندا فخیمی 2019
  17. بررسي سيستمي اثر بالقوه جهش هاي متابوليك بر ايجاد اختلالات طيف اوتيسم
    موهبت پورمجیدیان 2019
  18. مدل سازي مبتني بر قيد شبكه متابوليك فتوسنتزي به منظور استنتاج پيشران‌ها وخط سيرهاي تكامل فتوسنتز C4 از C3
    ارمین دادرس 2019
  19. بررسي اثر تركيبات تاثيرگذار پيش بيني شده از طريق مدلسازي مبتني بر قيد بر بيان آنزيم يوريكاز نوتركيب در باكتري /شريشيا كلاي
    نجمه سادات سیدکتولی 2019
  20. بررسي توانايي متابوليسمي خانواده Salinibacteraceae براساس داده‌هاي ژنوميك
    مریم باقری 2019
  21. بررسي تعييرات پروفايل بيان ژني سلولهاي بنيادي جنيني انسان در حالت Naive و Primed به منظور بازسازي مدل شبكه متابوليك و مطالعه تفاوت وضعيت متابوليك اين دو نوع سلو
    میثم یوسفی 2019
  22. ایجاد روشی برای برطرف کردن شکاف ها در شبکه های متابولیک با استفاده ار آنالیز همراهی شارها و اطلاعات بیان ژن های متابولیک
    ژاله حسینی 2018
  23. عنوان شبيه سازي رشد و متابوليسم تومور با استفاده از مدلهاي in vitro و in silico
    مهشید حیدری 2018
  24. مهندسي متابوليك اشرشياكلي به منظور افزايش مالونيل كوآ به عنوان متابوليت محدودكننده در مسير فنيل بروپانوئيدها
    محمدحسین متالهی اردکانی 2018
  25. بررسی تاثیر microRNA های ویروسی دخیل در خفتگی ویروس HSV-1 بر روی ژن های مسیر ?TGF-
    زهرا شجاعی جشوقانی 2018
  26. كنترل بيان ژن هاي موثر در بيماري آلزايمر با روش هاي تداخل در RNA
    سعیده حسینیان 2018
  27. كاربرد شبكه هاي متابوليكي ژنوم مقياس در پيش بيني تفاوت ها در توانمنديهاي بيوشيميايي بين دو گونه سودوموناس و نيز دو گونه باسيلوس
    طاهره قاسمی کهریز سنگی 2018
  28. بررسي شبكه متابوليكي جهت ارائه تعريفي جديد از اهميت ژنها به كمك آناليز همراهي شار
    سیدمحمدامین کمال الدین عزآبادی 2018
  29. بررسي الگوهاي تنظيم شبكه هاي زيستي توسط MicroRNA ها با رويكرد بيوانفورماتيكي
    مهدی احمدی 2018
  30. پروژه
    سلما سهرابی جهرمی 2018
  31. شناسايي حالت هاي پايه اي در شبكه هاي متابوليكي
    شایان تابع بردبار 2018
  32. دگر تمایزی سلول های فیبروپلاست به سلول های بنیادی عصبی با استفاده از روش هدایت پروتئینی
    مهدیه هادی 2018
  33. آناليز تواليهاي چاملئوني و بررسي نقش آنها در برخي از بيماريهاي مهم سيستم عصبي با استفاده از داده پايگاه هاي برهمكنش پروتئيني
    گلناز بهرامعلی 2018
  34. بازسازي شبكه متابوليكي سودوموناس اشتوتسري A1501
    پریزاد بابائی 2018

Master Theses

  1. بیان و تخلیص آنزیم فسفیت دهیدروژناز به منظور طراحی وتکامل وبهبود
    زهرا نیکوکار 2024
  2. شناسایی ژن های راهبر سرطان با استفاده از روش های یادگیری ماشین
    آیسان بالود 2024
  3. بررسی محاسباتی اثر حذف چرخه های بیهوده از شبکه متابولیک بر تولید NADH و NADPH و جفت شدگی آن با تولید 3و4-دی هیدروکسی بوتیریک اسید
    حانیه یوسف ابادی 2024
  4. دیدگاه های مبتنی بر هوش مصنوعی در مورد پیچیدگی های مرگ سلول های (Chinese hamster ovary) به منظور بهینه سازی فرایند های تولیدی.
    محمد مشفق نیا 2024
  5. بررسی ناهمگونی زیرجمعیت های میکروبی در ریه بیماران مبتلا به سیسستیک فیبروزیز با استفاده از روش تحلیل مولفه های مستقل
    محمدصدرا مدرسی اصطهباناتی 2024
  6. مدلسازی ساختار فنیل‌آلانین هیدروکسیلاز و آلفا گالاکتوزیداز توسط شبکه به منظور بررسی ارتباط جهش‌های دگرمعنای گزارش‌شده در انسان با رأس‌های مهم شبکه ساختاری پروتئین
    فاطمه قندالی 2023
  7. مدلسازی محاسباتی سازمان دهی فضایی تک سلولهای نمونه بافت زیستی با استفاده از داده تعیین توالی ترانسکریپتوم تک سلولی
    آسو خانی 2023
  8. مدل‌های مارکف پنهان ناپارامتری از دیدگاه بیزی
    عبدالله صفری 2023
  9. مقایسه پروفایل ژنی بیوپسی مایع DNA بدون سلول در گردش(ccfDNA) با بیوپسی بافتی تومورهای سرطانی متاستاز دهنده قبل و در حین درمان به منظور درک بهتر ارتباط ژنتیک سرطان و نشانگر‌های زیستی آن
    امید طرقی 2022
  10. مدل سازی شبکه متابولیکی نورون به منظور بررسی مکانیزم های دخیل دربیماریAmyotrophic Lateral sclerosis
    رعنا هوشنگ 2021
  11. بررسی بیماری ام اس با روش های یادگیری ماشین
    مطهره حب علی 2020
  12. مدلسازي متابوليسم همراه ريز جلبك كلرلا ولگاريس براي مطالعه شرايط رشد آن
    محمدامین قوامی 2019
  13. مدل هاي مار كف پنهان ناپارامتري از ديدگاه بيزي
    عبداله صفری 2018
  14. پيشگويي مناطق ذاتا بي نظم در پروتئين ها به كمك روش هاي طبقه بندي محلي
    محمدجواد نیرومند 2018
  15. شناسايي ژن هاي موثر برپيشرفت تومر از داده هاي ريز آرايه به وسيله روش بيز تجربي
    پویان نژادی 2018